آنالیز میکروسکوپ الکترونی عبوری (TEM) با توجه به توانایی در تصویربرداری از ذرات با بزرگنمایی نزدیک به یک میلیون برابر از روش های بسیار محبوب در مطالعه مواد نانوساختار است
آنالیز TEM برای اکثر انواع نمونه ها از جمله پلیمری، زیستی، پودری، محلول و دیسپرس قابل استفاده است
برای تصویر برداری در بزرگنمایی در محدوده فواصل صفحات اتمی می توان از آنالیز HRTEM که TEM با قدرت تفکیک بالا است استفاده نمود
این آنالیز قابلیت نشان دادن ذرات تا حدود 5 نانومتر را دارد